В соответствии со статьёй 17 Федерального закона от 07.02.2011 N 6-ФЗ “Об общих принципах организации и деятельности контрольно-счётных органов субъектов Российской Федерации и муниципальных образований” и статьёй 19 Закона Краснодарского края от 04.10.2011 N 2321-КЗ “О Контрольно-счётной палате Краснодарского края” руководители проверяемых органов и организаций могут давать пояснения и замечания на акты, составленные Контрольно-счётной палатой при проведении контрольных мероприятий. Пояснения и замечания, представленные в срок до пяти рабочих дней со дня получения акта (актов), прилагаются к актам и в дальнейшем являются их неотъемлемой частью.
Также проверяемые органы и организации и их должностные лица вправе обратиться с жалобой на действия (бездействие) Контрольно-счётной палаты Краснодарского края в Законодательное Собрание Краснодарского края.